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《生物信息學》考試大綱

一、基本要求

掌握生物信息學常用數(shù)據(jù)庫和使用方法;掌握序列比對方法和主要比對軟件使用方法;掌握DNA序列和蛋白質(zhì)序列特征分析和常用序列分析軟件包使用方法;掌握分子進化理論和常用分析方法;掌握基因功能注釋方法和常用軟件使用方法;掌握基因表達數(shù)據(jù)分析方法和常用分析軟件使用方法。

二、考試范圍

1. 課程相關知識

基本要求：掌握生物信息學的定義、基本概念和發(fā)展;掌握生物信息學研究的基本內(nèi)容、基本原理和生物學基礎;了解計算機在生物研究中的應用;了解生物信息學發(fā)展史、開發(fā)與產(chǎn)業(yè)化。

1.生物信息學數(shù)據(jù)庫

(1)知識點1：NCBI數(shù)據(jù)庫的介紹

(2)知識點2：Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫

(3)知識點3：PDB數(shù)據(jù)庫

基本要求： 掌握NCBI數(shù)據(jù)庫的建設和使用方法;掌握Swiss-Prot和PDB數(shù)據(jù)庫的使用方法。

2.序列比對

(1)知識點1：雙重序列比對分析

(2)知識點2：多序列比對分析

(3)知識點3：BLAST數(shù)據(jù)庫搜索

基本要求：掌握序列比對的原理和方法;掌握如何使用BLAST軟件進行數(shù)據(jù)庫搜索和同源性分析。

3.序列特征分析

(1)知識點1：DNA序列特征分析

(2)知識點2：蛋白質(zhì)序列特征分析

基本要求：掌握基因預測的原理和方法;掌握啟動子區(qū)域預測和分析的原理和方法;掌握蛋白質(zhì)序列跨膜區(qū)分析的原理和方法。

4.分子進化分析

(1)知識點1：系統(tǒng)發(fā)育樹的概念

(2)知識點2：分子進化理論

(3)知識點3：系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建

基本要求：掌握系統(tǒng)發(fā)育樹的概念;掌握DNA和蛋白質(zhì)序列適應性進化的分子理論;掌握系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建的原理和方法。

5. 基因功能注釋

(1)知識點1：基因功能的基本概念

(2)知識點2：基因功能的注釋原理和方法

基本要求：掌握基因注釋和功能分類的基本概念;掌握基因功能注釋的原理和方法;掌握常用基因功能注釋軟件的使用;

6.基因表達數(shù)據(jù)分析

(1)知識點1：基因表達數(shù)據(jù)獲取的生物學技術平臺

(2)知識點2：基因表達數(shù)據(jù)分析

基本要求：掌握基因表達技術的主要生物學平臺;掌握基因表達數(shù)據(jù)的主要分析方法和原理;掌握基因表達數(shù)據(jù)分析常用軟件的使用。