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發(fā)酵工程碩士點是福建師范大學(xué)最早建立的工科碩士點之一，依托福建省“211”重點學(xué)科“發(fā)酵工程學(xué)”，“福建省現(xiàn)代發(fā)酵技術(shù)工程研究中心”和“福建省發(fā)酵技術(shù)科研平臺”。

研究方向：

（1）工業(yè)微生物：產(chǎn)有用代謝產(chǎn)物(包括氨基酸、有機酸、維生素、核酸、抗生素等)的微生物分離、育種、高密度培養(yǎng)、代謝產(chǎn)物的分離純化、以及結(jié)構(gòu)基因的克隆與表達。

（2）發(fā)酵過程優(yōu)化控制：研究高產(chǎn)菌株及基因工程菌發(fā)酵過程的特性、細胞代謝流分布，在上述研究基礎(chǔ)上的發(fā)酵過程優(yōu)化(提高產(chǎn)物生產(chǎn)水平，生產(chǎn)能力和產(chǎn)物對于主要底物的轉(zhuǎn)化率等)，生物轉(zhuǎn)化過程的優(yōu)化，生物反應(yīng)器性能研究、強化及操作，發(fā)酵及生物轉(zhuǎn)化過程的放大。

（3）生化反應(yīng)過程工程：研究生化反應(yīng)過程中各種熱功、化學(xué)及生物變量的檢測技術(shù)，生物傳感器的研究和應(yīng)用，生物反應(yīng)過程數(shù)據(jù)的采集和分析，生物反應(yīng)過程的計算機模擬和優(yōu)化，人工智能在生物反應(yīng)過程中的應(yīng)用，計算機輔助的生物反應(yīng)過程的放大等。

（4）生物大分子：通過蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)研究、定點突變、隨機誘變、DNA shuffling等技術(shù)，對各種重要微生物產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系進行研究。主要研究領(lǐng)域有脂肪酶、蛋白酶、葡聚糖酶等重要微生物酶類、微生物不飽和脂肪酸及生物材料等。

本碩士點目前由9名碩士生導(dǎo)師(其中教授4人，副教授5人)和一批具有博士和碩士學(xué)位的青年教學(xué)科研骨干組成。該學(xué)科經(jīng)過多年建設(shè)取得了豐碩及高水平的科研成果，在國內(nèi)同行中有較大的影響，是福建省經(jīng)濟建設(shè)和社會發(fā)展所急需的學(xué)科。近幾年承擔(dān)國家自然科學(xué)基金4項，“九五”攻關(guān)項目1項，省自然科學(xué)基金項目16項，省發(fā)改委項目5項，橫向項目30余項。獲省部以上科技獎8項(其中省科研成果一等獎1項、教育部提名科技進步二等獎1項、省科技進步二等獎4項、三等獎2項)，獲得及申請發(fā)明專利5項，在國內(nèi)外發(fā)表論文140余篇，被SCI、EI收錄論文20多篇。